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本文標題:"微生物中獲取出來-已知的微生物分析顯微鏡"

新聞來源:未知 發布時間:2018-5-9 17:15:10 本站主頁地址:http://www.pzfczx.com

微生物中獲取出來-已知的微生物分析顯微鏡

  位素微陣列中,放射性標記RNA(特別包括14C)從樣本中提取出來并
進行熒光子標記,然后靶向識別相應的不同微生物的16S rRNA。在這種
方法中,可以攝取標記的生物可以被快速分離,不用事先了解共有的成
分(Adamczyk等,2003)。同位素微陣列是一種高通量篩選方法可以縮短
孵育時間。但是與SIP不同,同位素微陣列只能檢測序列已知的微生物
,因此考慮到這點,它的限制性更強。像先前討論中提到FISH—MAR技
術的限制是生物代謝靜止(或簡單慢速生長)的時候樣本將會消失,而且
這項技術對放射標記的基質研究也同樣受到限制。   基因組組合技術

  雖然同位素標記能將特殊代謝能力和環境中的特殊微生物聯系起來
,但不能了解它是整個代謝中的哪個環節。這些問題,可以用基因組推
斷潛在的代謝能力或催化地質化學反應的能力來擬補。強調它是潛在的
,對基因組研究再好不過了,因為它能夠暗示目標生物可能進行的代謝
。這種分析(經常稱為代謝組學;Risesenfeld等,2004;DeLong,2007
)依賴繁瑣的計算分析來比較每個不同序列,從而鑒定DNA基序或預測基
因產物的特殊功能。還可以推測相關一種已知蛋白可能催化的反應,或
在哪種基因的編碼情況下它能夠表達;有時,基因組分析甚至能應用于
整個微生物群落的活動中(Tyson等,2004;DeLong等,2006)。最終,
這些假設可能通過經典基因檢測和生化分析來證明特殊基因的存在,推
斷的代謝或地質化學作用(見8.4部分和Martinez等,2007)。多種方法
能夠將基因組信息從特殊環境的微生物中獲取出來(例如,磁電機一FIS
H,數字PCR)。因此即使細胞宿主已經丟失,如果有足夠量DNA能克隆到
重裝的整個基因組中,宏基因組學仍可以特定生物體獲得。我們強調假
設,因為從環境DNA重建最初的基因組依舊具有很大挑戰性。不僅是基
因的表達原位監測(Ram等,2005),而且可以追蹤到自然環境中特定基
因型和它們關系較近的種群(Rich等,2008)以指導培養基的設計來分離
/研究特殊地質微生物(Tysom等,2005;Sabehi等,2005)。關于地質
微生物在地質微觀背景中基因組學面臨的問題、機遇和挑戰更全面的討
論見Banfield等(2005)。8.3.5代謝基因的表達或它們基因產物的探
針檢測

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