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本文標(biāo)題:"光學(xué)儀器常識-怎樣使用顯微鏡拍攝細(xì)胞"

新聞來源:未知 發(fā)布時間:2013-5-13 17:07:41 本站主頁地址:http://www.pzfczx.com

光學(xué)儀器常識-怎樣使用顯微鏡拍攝細(xì)胞

影像類別分類

每張顯微影像因為細(xì)胞組織與背景的比例不同,整張影像的色彩分布就會不一樣。
當(dāng)影像中細(xì)胞組織與背景的分布比例相同時,后續(xù)欲進行之色彩正規(guī)化才有其效果,否則會因為色彩差異過大,
而失去了不同類型影像所應(yīng)有的色彩分布。因此我們必須先對影像做分類,以利于后續(xù)進行色彩正規(guī)化時,
能適當(dāng)?shù)拿枋錾史植肌?/div>

在這個步驟我們會利用影像的亮度標(biāo)準(zhǔn)差,
將影像區(qū)分為三大類:

第一類為乾淨(jìng)影像類型(影像大部分為背景)、

第二類為稍微複雜影像類型(影像包含部分細(xì)胞與組織)

第三類為複雜影像類型(影像大部分為組織,背景只占小部分)。




去除亮背景
從影像上可以發(fā)現(xiàn),每張顯微影像當(dāng)中,若是有細(xì)胞組織的地方,其亮度值會比較低且偏暗;
反之在無其他細(xì)胞組織的地方,其亮度值比較高且偏亮,因此我們將其稱為亮背景。亮背景在影像中佔了蠻大的比例,因此如果能先將這些亮背景去除,則可以減少背景的影響,更能有效率的針對剩馀細(xì)胞組織來偵測結(jié)核菌。

去除亮背景的閥值,當(dāng)亮度值超過這個閥值,則屬于亮背景,欲將其去除,反之為細(xì)胞組織而欲將其保留。
max_Intensity為影像亮度分布中出現(xiàn)最多次數(shù)的亮度值,k值為經(jīng)驗值,于每一類所使用的k值皆不太相同,
std為影像亮度標(biāo)準(zhǔn)差。

結(jié)核菌候選區(qū)域偵測
經(jīng)過前面的影像前處理之后,我們已經(jīng)將可能包含結(jié)核菌的組織分割出來,因此后續(xù)的動作,
僅針對可能包含結(jié)核菌的部分做處理,如此也能減少后續(xù)的處理時間。
接下來將介紹偵測結(jié)核菌所使用的色彩參數(shù)以及所使用的高斯混合模型(Gaussian Mixture Model, GMM)。

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