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地質微生物學的分子生物學方法
除了地質微生物學研究的常規技術,分子生物學工具在研究地質微
生物的存在、催化活性及機制方面也越來越重要。現在,多種分子(DNA
,RNA,蛋白質和磷脂)技術已應用于特異地質微生物的原位檢測,配合
同位素組分分析可識別目標分子,這些技術不僅能夠鑒定地質微生物種
類,還有助于了解其代謝動力學。基因組序列及生物物理技術的整體快
速發展將極大地擴展我們對已分離微生物基因功能的了解,還將增加我
們對環境中不可培養微生物種類的認識。最后,利用基因組學,細胞生
物和生物化學技術對基因及其產物催化地質化學反應的研究也有助于對
地質微觀變化機制的了解。同時,通過這些分子生物學工具的分析能夠
預測將要發生的微生物活動并估測他們對環境的地質化學影響。
哪些微生物在起作用?地質微生物的鑒定
鑒定純培養微生物的分子方法包括DNA/DNA雜交,DNA/RNA雜交,
DNA指紋和16S核糖體RNA(16S rRNA)分析。DNA指紋包括從未知生物的純
培養中提取DNA,用特異限制酶降解DNA,將其切割成多核苷酸片段,消
化后電泳,并與同樣方法處理的已知微生物純培養DNA相應部分相比較
。因為有大量的地質微生物不可分離培養,所以不依賴培養的鑒定方法
就尤為重要。
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